Колонофлор - биоценоз, ПЦР

Цель исследования

Анализ предназначен для количественной оценки состояния микробиоценоза толстого кишечника и выявления дисбиотических нарушений у детей от 14 лет и взрослых.

Список выявляемых показателей:

Нормальная флора и анаэробные микроорганизмы:              

• Общая бактериальная масса
• Lactobacillus spp.
• Bifidobacterium spp.
• Faecalibacterium prausnitzii
• Bacteroides thetaiotaomicron
• Bacteroides spp./Faecalibacterium prausnitzii

Условно-патогенные микроорганизмы, вызывающие воспаление, диарею и диспептические явления:

• Klebsiella pneumoniae
• Klebsiella oxytoca
• Candida spp
• Enterobacter spp.
• Clostridium difficile
• Clostridium perfringens
• Staphylococcus aureus
• Proteus vulgaris/mirabilis
• Citrobacter spp.

Абсолютно патогенные микроорганизмы, возбудители острых кишечных инфекций:

• Escherichia coli enteropathogenic
• Salmonella spp.
• Shigella spp.

Микроорганизмы-маркёры заболеваний (их выявление или изменение количества может сигнализировать о различных патологических состояниях):

• Akkermansia muciniphila
• Fusobacterium nucleatum
• Parvimonas micra

Подготовка к исследованию

Для исследования необходима порция кала (не более 1/3 контейнера), собранная путем естественной дефекации. Исследование целесообразно проводить не ранее чем через 2 недели после проведенной антибактериальной терапии.

Порядок сбора кала:

1. До сбора биоматериала помочитесь в унитаз. Во время сбора кала избегать примесей мочи и отделяемого половых органов.

2. Отбирать пробу из унитаза нельзя. Нужно использовать подкладное судно или горшок, новый полиэтиленовый пакет. Емкость предварительно хорошо вымыть с мылом. Многократно ополоснуть проточной водой. Обдать кипятком. Высушить. Дезинфицирующие средства не использовать.

3. Фекалии собирают сразу специальной ложечкой в стерильный контейнер. 4. Плотно завинтите крышку.

Условия хранения и транспортировки биоматериала:

Материал должен быть доставлен в медицинский центр "УГМК-Здоровье" в день сбора. Желательно доставить в охлажденном, но не замороженном виде при +2…+8°С (например, в термосе с кубиком льда или пакете с хладоэлементами).

Исследуемый материал  

Кал

Метод исследования, оборудование

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени (Real-time PCR)

Референсные значения

• Общая бактериальная масса: 10^11 – 10^13
• Lactobacillus spp.: 10^7 – 10^8
• Bifidobacterium spp.: 10^9 – 10^10
• Escherichia coli: 10^6 – 10^8
• Bacteroides spp.: 10^9 – 10^12
• Faecalibacterium prausnitzii: 10^8 – 10^11
• Соотношение Bacteroides spp./ Faecalibacterium prausnitzii: 0,01-100
• Enterococcus spp.: не более 10^8
• Bacteroides thetaiotaomicron: допустимо любое количество
• Candida spp.: не более 10^4
• Klebsiella pneumoniae: не более 10^4
• Klebsiella oxytoca: не более 10^4
• Staphylococcus aureus: не более 10^4
• Enterobacter spp.: не более 10^4
• Clostridium difficile: не обнаружено
• Clostridium perfringens: не обнаружено
• Proteus vulgaris / Proteus mirabilis: не более 10^4
• Citrobacter spp.: не более 10^4
• Fusobacterium nucleatum: не обнаружено
• Parvimonas micra: не обнаружено
• Akkermansia muciniphila: не более 10^11      
• Escherichia coli enteropathogenic: не более 10^4
• Salmonella spp.: не обнаружено
• Shigella spp.: не обнаружено

Интерпретация

По результатам исследований «Колонофлор» автоматически формируется описание на основе сравнения показателей с референсными интервалами. Описание отражает качественный и количественный состав микрофлоры, наличие дисбиотических нарушений. Также для каждого результата формируется заключение. Интерпретация результатов должна проводиться врачом с учетом клинической картины и анамнеза.

Литература

1. Курбатов В. А., Андреев Б. А., Нефедова Л. И. Метаболиты кишечного микробиома и их влияние на здоровье человека //Здоровье. Медицинская экология. Наука. – 2020. – №. 2 (81).
2. Ситкин С. И., Вахитов Т. Я., Демьянова Е. В. Микробиом, дисбиоз толстой кишки и воспалительные заболевания кишечника: когда функция важнее таксономии //Альманах клинической медицины. – 2018. – Т. 46. – №. 5.
3. Гаус О. В., Беляков Д. Г. Современные взгляды на роль кишечной микробиоты в формировании патологии кишечника//Русский медицинский журнал. – 2021. – №. 4.– С. 10-16.
4. Методические рекомендации КОЛОНОФЛОР Исследование количественного состава микробиоты кишечника методом ПЦР в реальном времени. ООО «Альфа Лаб».

С этим исследованием часто назначают:

• Колонофлор-8 (скрининг), ПЦР
• Колонофлор - метаболизм, ПЦР
• Микробиологическое исследование кала на патогенную и условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам (расширенный спектр) и антимикотическим препаратам
• Копрологическое исследование
• Исследование кала на скрытую кровь (количественно)
• Кал на яйца гельминтов и простейшие методом обогащения (Parasep)
• ПРОТО-скрин, ПЦР (ДНК Lamblia Giardia, Blastocystis hominis, Dientamoeba fragilis, Isospora belli, Cryptosporidium parvum, Entamoeba histolytica)