Биотоп "Просветная микробиота толстой кишки" (анализ микробных маркеров методом газовой хромато-масс-спектрометрии по Осипову)

Цель исследования

Выявление и идентификация микробиоты толстой кишки для оценки состава и баланса микробиологических организмов. Исследование рекомендовано пациентам при дисбактериозе или подозрении на него.

Подготовка к исследованию

Для исследования необходима средняя порция фекалий. В медицинском центре "УГМК-Здоровье" на регистратуре приобрести стерильный контейнер с ложкой для сбора биоматериала.

Кал собирается до начала лечения антибиотиками и химиопрепаратами и препаратами флоры. Для исследования собирают свежевыделенный кал. Материал, собранный с несвежего постельного белья, искажает результат, а заполненный до верха контейнер анализу не подлежит. За 3-4 дня отменить прием слабительных препаратов, прекратить введение ректальных свечей. Кал, полученный после клизмы, приема бария для исследования непригоден. Полученные результаты будут в значительной степени зависеть от надлежащего и соответствующего сбора анализа, так же как и от скорости доставки материала в лабораторию.

Порядок сбора кала:

1. До сбора биоматериала помочитесь в унитаз. Во время сбора кала избегать примесей мочи, отделяемого половых органов и кусочков не переваренной пищи.
2. Отбирать пробу из унитаза нельзя. Нужно использовать подкладное судно или горшок, новый полиэтиленовый пакет. Емкость предварительно хорошо вымыть с мылом. Многократно ополоснуть проточной водой. Обдать кипятком. Высушить. Дезинфицирующие средства не использовать.
3. Фекалии собирают сразу специальной ложечкой в стерильный контейнер. У грудных детей материал собирать, подстелив под малыша новую клеенку.
4. Плотно завинтите крышку.

До отправки биоматериал должен храниться в холодильнике при +2…+8°С. Материал должен быть доставлен в медицинский центр "УГМК-Здоровье" в день сбора. Желательно доставить в охлажденном, но не замороженном виде при +2…+8°С (например, в термосе с кубиком льда или пакете с хладоэлементами).

На исследование не принимается материал:

• материал, собранный в нестерильный или неплотно закрытый контейнер;
• материал, собранный с памперса;
• материал, собранный в несколько приемов в один контейнер в течение более 24 часов;
• материал, хранившийся более 2 часов при температуре +20…+25°С в стерильном контейнере;
• материал, который был заморожен.

Исследуемый материал  

Кал.

Метод исследования, оборудование

Газовая хромато-масс-спектрометрия по Осипову.

Интерпретация

Результатом исследования является заключение, содержащее информацию о микробиоте толстой кишки. Для детальной интерпретации результатов необходима консультация специалиста и учет клинико-анамнестических данных.

Литература

1. James KR, Gomes T, Elmentaite R, Kumar N, Gulliver EL, King HW, Stares MD, Bareham BR, Ferdinand JR, Petrova VN, Polański K, Forster SC, Jarvis LB, Suchanek O, Howlett S, James LK, Jones JL, Meyer KB, Clatworthy MR, Saeb-Parsy K, Lawley TD, Teichmann SA. Distinct microbial and immune niches of the human colon. Nat Immunol. 2020 Mar;21(3):343-353. doi: 10.1038/s41590-020-0602-z. Epub 2020 Feb 17. PMID: 32066951; PMCID: PMC7212050.
2. Корниенко, Е. А. Микробиота кишечника как ключевой фактор формирования иммунитета и толерантности. Возможности пробиотиков / Е. А. Корниенко // Медицинский совет. – 2020. – № 10. – С. 92-100. – DOI 10.21518/2079-701X-2020-10-92-100. – EDN BOIHAB.
3. Особенности микробиома толстой кишки у пациентов с ожирением при его различных фенотипах (оригинальная статья) / А. М. Гапонов, Н. И. Волкова, Л. А. Ганенко [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2021. – Т. 98, № 2. – С. 144-155. – DOI 10.36233/0372-9311-66. – EDN XDKOOX.
4. Amitay EL, Krilaviciute A, Brenner H. Systematic review: Gut microbiota in fecal samples and detection of colorectal neoplasms. Gut Microbes. 2018 Jul 4;9(4):293-307. doi: 10.1080/19490976.2018.1445957. Epub 2018 May 15. PMID: 29543545; PMCID: PMC6219654.

С этим исследованием часто назначают:

• Биотоп "Тонкая кишка" (анализ микробных маркеров методом газовой хромато-масс-спектрометрии по Осипову)
• Исследование кала на дисбактериоз с определением чувствительности к антибиотикам (основной спектр)
• Исследование кала на условно-патогенную и патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам (основной спектр)
• Исследование микробиоценоза кишечника (дисбактериоз) культуральным методом с определением чувствительности к антибиотикам (расширенный спектр) и бактериофагам
• Микробиологическое исследование кала на патогенную и условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам (расширенный спектр) и антимикотическим препаратам