Микробиологическое исследование кала на патогенную и условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам (расширенный спектр) и антимикотическим препаратам

Цель исследования

Анализ кала на условно-патогенную и патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам для количественной и качественной оценки микробиома кишечника. Исследование рекомендовано для дифференциальной диагностики заболеваний, сопровождающихся абдоминальными болями, тошнотой, рвотой, длительно текущих кишечных инфекций.

Подготовка к исследованию

Инструкция по сбору биоматериала:

Для исследования необходима средняя порция испражнений. В медицинском центре "УГМК-Здоровье" на регистратуре приобрести стерильный контейнер с ложкой для сбора биоматериала.

Информация о предварительной подготовке к исследованию:

Кал собирается до начала лечения антибиотиками и химиопрепаратами и препаратами флоры или не ранее 2-3 недель после ее окончания. Для исследования собирают свежевыделенный кал.

Материал, собранный с несвежего постельного белья, искажает результат, а заполненный до верха контейнер анализу не подлежит. За 3-4 дня отменить прием слабительных препаратов, прекратить введение ректальных свечей. Кал, полученный после клизмы, приема бария для исследования непригоден. Полученные результаты будут в значительной степени зависеть от надлежащего и соответствующего сбора анализа, также, как и от скорости доставки материала в лабораторию.

Порядок сбора кала:

1. До сбора биоматериала помочитесь в унитаз. Во время сбора кала избегать примесей мочи, отделяемого половых органов и кусочков не переваренной пищи.

2. Отбирать пробу из унитаза нельзя. Нужно использовать подкладное судно или горшок, новый полиэтиленовый пакет. Емкость предварительно хорошо вымыть с мылом. Многократно ополоснуть проточной водой. Обдать кипятком. Высушить. Дезинфицирующие средства не использовать.

3. Фекалии собирают сразу специальной ложечкой в стерильный контейнер. У грудных детей материал собирать, подстелив под малыша новую клеенку.

4. Плотно завинтите крышку.

Не принимается на исследование:

• материал, собранный в нестерильный или неплотно закрытый контейнер;
• материал, собранный с памперса;
• материал, собранный в несколько приемов в один контейнер в течение больше 24 часов;
• материал, хранившийся более 2 часов при температуре +20…+25°С в стерильном контейнере без транспортной среды;
• материал, который был заморожен.

Условия хранения и транспортировки биоматериала:

До отправки биоматериал должен храниться в холодильнике при +2…+8°С не более 4 часов. Материал должен быть доставлен в медицинский центр "УГМК-Здоровье" в день сбора. Желательно доставить в охлажденном, но не замороженном виде при +2…+8°С (например, в термосе с кубиком льда или пакете с хладоэлементами).

Исследуемый материал  

Кал.

Метод исследования, оборудование

Культуральный метод.

Тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам проводится фенотипическим методом в соответствии с рекомендациями EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing), используются критерии оценки Clinical breakpoints - bacteria (v 12.0), 2022. Идентификация микроорганизмов методом MALDI-TOF (масс-спектрометрия) в анализаторе VITEK MS.

Интерпретация

Результатом исследования является заключение, содержащее информацию о выделенных условно-патогенных и патогенных микроорганизмах в кале. Для детальной интерпретации результатов необходима консультация специалиста и учет клинико-анамнестических данных.

Снижение или повышение числа микроорганизмов в микробиоме кишечника может быть связано с дисбактериозом при различных гастроэнтерологических заболеваниях. Умеренный рост условно-патогенных микроорганизмов не всегда связан с развитием кишечной инфекции, в отличии от обильного роста, который часто является причиной кишечной инфекции.

Литература

1. Barko PC, McMichael MA, Swanson KS, Williams DA. The Gastrointestinal Microbiome: A Review. J Vet Intern Med. 2018;32(1):9-25. doi:10.1111/jvim.14875
2. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, Elinav E. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. doi:10.1038/nri.2017.7
3. Shanahan F, Ghosh TS, O'Toole PW. The Healthy Microbiome-What Is the Definition of a Healthy Gut Microbiome?. Gastroenterology. 2021;160(2):483-494. doi:10.1053/j.gastro.2020.09.057
4. Haran JP, McCormick BA. Aging, Frailty, and the Microbiome-How Dysbiosis Influences Human Aging and Disease. Gastroenterology. 2021;160(2):507-523. doi:10.1053/j.gastro.2020.09.060

С этим исследованием часто назначают:

• Исследование кала на дисбактериоз с определением чувствительности к антибиотикам (основной спектр)